Verhofstadt studeerde rechten en pers- en communicatiewetenschappen aan de Universiteit Gent, werkte jarenlang in de mediasector en haalde in juli 2010 de graad van Doctor in de Moraalwetenschappen aan de Faculteit Letteren en Wijsbegeerte van de Universiteit Gent met zijn proefschrift Pius XII en de vernietiging van de Joden. Een historisch en moraalwetenschappelijk onderzoek naar de morele verantwoordelijkheid van paus Pius XII ten aanzien van de Endlösung der Judenfrage. Dirk Verhofstadt was enkele jaren professor 'Media en ethiek' in de vakgroep Communicatiewetenschappen maar werkt vandaag niet meer voor de UGent.

Biblio